审计机构不可以代理记账，代理记账是指会计咨询、服务机构及其他组织等经批准设立从事会计代理记账业务的中介机构接受独立核算单位的委托，代替其办理记账、算账、报账业务的一种社会性会计服务活动。
社会审计
社会审计也称注册会计师审计或独立审计，是指注册会计师依法接受委托、独立执业、有偿为社会提供专业服务的活动。社会审计的产生源于财产所有权和管理权的分离。社会审计制度的确立是中国实行改革开放政策，建立社会主义市场经济体制的必然要求，对促进改革开放和经济发展发挥了重要作用。
民间审计组织主要有会计师事务所、审计师事务所等。社会审计只有在接受委托时，才能对被审计单位进行审计，审计的内容和目的决定于委托人的要求，此时享有国家审计机关同样的审计监督权，否则无权独立行使审计的监督权，但它同样具有独立性和权威性。社会审计的主要任务还有:审查中外合资企业的经济活动和外资独营企业的经济活动，为社会提供咨询服务,审查和验证上市股份公司的财务报告等。
独立审计
独立审计，即由注册会计师受托有偿进行的审计活动，也称为民间审计。我国注册会计师协会（CICPA）在发布的《独立审计基本准则》中指出：“独立审计是指注册会计师依法接受委托，对被审计单位的会计报表及其相关资料进行独立审查并发表审计意见。”独立审计的风险高，责任重，因此审计理论的产生、发展及审计方法的变革都基本上是围绕独立审计展开的。
