增值税扣税凭证，是纳税人购进货物、加工修理修配劳务、服务、无形资产或者不动产时取得或开具的记载所支付或者负担的增值税额，并据此从销项税额中抵扣进项税额的凭证。
近期小编注意到，不少财务人员收到增值税扣税凭证、核算进项税额时，不能准确区分凭票面税额抵扣和计算抵扣两种情形。下文小编就整理归纳下计算抵扣增值税进项税额的三种情形。
情形一：桥、闸通行费
纳税人支付的桥、闸通行费，暂凭取得的通行费发票上注明的收费金额按照下列公式计算可抵扣的进项税额：
桥、闸通行费可抵扣进项税额=桥、闸通行费发票上注明的金额÷(1+5%)×5%
提醒：
1.通行费，是指有关单位依法或者依规设立并收取的过路、过桥和过闸费用。
2.办理纳税申报填列《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）时，上述计算抵扣进项税额填入第8b栏“其他”。
3.纳税人支付的高速公路、一级公路、二级公路通行费，按照收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税额抵扣进项税额。
 
情形二：旅客运输服务
纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。纳税人未取得增值税专用发票的，暂按照以下规定确定进项税额：
1.取得注明旅客身份信息的航空运输电子客票行程单的，按照下列公式计算进项税额：
航空旅客运输进项税额=（票价+燃油附加费）÷（1+9%）×9%
2.取得注明旅客身份信息的铁路车票的，按照下列公式计算的进项税额：铁路旅客运输进项税额=票面金额÷（1+9%）×9%
3.取得注明旅客身份信息的公路、水路等其他客票的，按照下列公式计算进项税额：公路、水路等其他旅客运输进项税额=票面金额÷（1+3%）×3%
提醒：
1.自2019年4月1日起，纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。
 
2.纳税人购进国内旅客运输服务，取得增值税专用发票的，按规定可抵扣的进项税额在申报时填写在申报表《附列资料（二）》专用发票相应栏次中。
 
纳税人购进国内旅客运输服务，未取得增值税专用发票的，以增值税电子普通发票注明的税额，或凭注明旅客身份信息的航空、铁路、公路、水路等票据，按政策规定计算的可抵扣进项税额，填写在申报表《附列资料（二）》第8b栏“其他”中申报抵扣。
 
同时，填写10栏“（四）本期用于抵扣的旅客运输服务扣税凭证”包含第1栏和第4栏中按规定本期允许抵扣的购进国内旅客运输服务对应数据。
 
情形三：购进农产品
纳税人购进农产品，按下列规定计算抵扣进项税额：
1.从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额。
2.取得（开具）农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
3.纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。
提醒：
1.纳税人购进农产品既用于生产销售或委托受托加工13%税率货物又用于生产销售其他货物服务的，应当分别核算用于生产销售或委托受托加工13%税率货物和其他货物服务的农产品进项税额。
未分别核算的，统一以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额为进项税额，或以农产品收购发票或销售发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额。
2.办理纳税申报填列《增值税纳税申报表附列资料（二）》（本期进项税额明细）时，上述进项税额对应填列到第6栏“农产品收购发票或者销售发票”（反映纳税人本期购进农业生产者自产农产品取得（开具）的农产品收购发票或者销售发票情况）和第8a栏“加计扣除农产品进项税额”（反映纳税人将购进的农产品用于生产销售或委托受托加工13%税率货物时加计扣除的农产品进项税额）。
3.纳税人购进农产品，取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书的，以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额为进项税额。（购进用于生产销售或委托受托加工13%税率货物的农产品除外）
 
本文政策依据
《国家税务总局关于调整增值税纳税申报有关事项的公告》（国家税务总局公告2019年第15号）
《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号）
《财政部 国家税务总局关于租入固定资产进项税额抵扣等增值税政策的通知》（财税〔2017〕90号）
《财政部 税务总局关于简并增值税税率有关政策的通知》（财税〔2017〕37号）
《财政部 税务总局关于调整增值税税率的通知》（财税〔2018〕32号）